Relieve

El relieve de esta provincia se divide en dos áreas bien diferencias: una al oeste, la zona cordillerana, constituida por los Andes Patagónicos; y otro hacia el centro y este, donde comienza el área de mesetas que terminan en las costas del Mar Argentino, constituyendo un relieve en forma escalonada que continúa más allá de la costa, en la plataforma continental.

Los Andes Patagónicos Fueguinos fueron originados durante el Cenozoico y los últimos ascensos se produjeron en el cuaternario. Tienen dirección Noreste - Suroeste. Presentan valles transversales que cortan la cordillera, profundas y extensas cuencas Lacustres y campos de hielo continental. Sometidos a la acción de los vientos húmedos del Pacífico, constituyen una de las regiones con mayores precipitaciones del territorio argentino, favoreciendo el desarrollo de abundante vegetación de coníferas y hayas. Lo escarpado del terreno, los ríos, arroyos, cascadas, lagos, bosques y nieve confieren al lugar una belleza sin igual. Las cadenas orográficas Nirihuau, de las Bayas, Nevado e Ipela, albergan los cerros y volcanes Tronador, Catedral y Ventisquero.

La meseta o pampa patagónica están constituidas por rocas cristalinas precámbricas cubiertas de rodados patagónicos y mantos basálticos. Se inician sobre el Océano Atlántico a una altura de 70 metros, alcanzando en el interior los 1000 metros. En esta región se encuentra un grupo de sierras muy antiguo denominado Patagónides, que tienen su origen en el Mesozoico -Cretáceo. Estas sierras, que se extienden también por las Provincias de Neuquén y Chubut, tienen la particularidad de adoptar la forma de arcos con concavidades orientadas hacia el este, muy erosionadas, de escasa altura, presenta cumbres redondeadas.

Las costas de la región patagónica difieren fundamentalmente de las costas de la región pampeana, esto se hace evidente a partir de la desembocadura del río Negro, donde el litoral de llanuras y playas amplias deja lugar a profundas entrantes, golfos y bahías, como salientes pronunciadas y penínsulas. Desde las proximidades del río Negro, una cadena de colinas de 60 metros de altura acompaña la costa, constituyendo acantilados.

Hidrografía

Se diferencian en la provincia dos cursos principales, con una red de drenaje bien definida y numerosos cursos pequeños. Además cuenta con un sistema lacustre del oeste de la provincia. La hidrología rionegrina comprende dos vertientes, del Océano Atlántico y del Océano Pacífico y Lagos. Los principales ríos de la vertiente del Atlántico son:

• Río Colorado: se ubica en el norte, constituyendo el límite entre Río Negro y la Pampa. Su cauce es hacia el sudeste, salvo en las cercanías de Colonia Catriel. Sus aguas son turbias por la erosión que ejercen los ríos que lo forman. Montañas basálticas de hasta 100 metros de altura lo acompañan, hasta que paulatinamente desaparecen para convertirse en terrazas bajas y arenosas. El ancho del río oscila entre los 100 y 300 metros. Paredones del valle distanciados en algunos tramos hasta 4 kilómetros son prueba de que antiguamente el río era muy caudaloso y de fuerte poder erosivo. No recibe afluentes, por lo que su caudal disminuye progresivamente. El tramo final presenta la forma de delta. Desagua en el Océano Atlántico, formando un litoral bajo, medanoso, desolado y árido.
  
• Río Neuquén: constituye el límite entre las provincias de Neuquén y Río Negro. Este río de 510 kilómetros de largo, es rápido, correntoso, tal como lo dice su nombre que en araucano significa audaz y arrogante. Recibe numerosos afluentes que recogen las abundantes lluvias cordilleranas. Al sur y próximo a su tramo final, se halla la cuenca Vidal con el dique Ballester, hacia donde derivan las aguas en crecientes.
  
• Río Limay: Nace en el Lago Nahuel Huapi y define el límite entre las provincias de Neuquen y Río Negro. Mide 430 kilómetros de largo y en su recorrido salva un desnivel de 508 metros. Numerosos lagos interpuestos en su cuenca lo hacen más regular, menos impetuoso y menos rápido que el río Neuquen. Este río recibe sus mayores afluentes del sector neuquino, en Río Negro solo tiene dos afluentes, el Pichileufú y el Comallo y algunos arroyos temporarios. A la altura de Picún Leufú, en Neuquén, el río se transforma en un lago artificial, formando la represa de El Chocón. Aporta la mayor parte del caudal del Río Negro.
  
• Río Negro: es el colector más importante de la provincia. Nace de la confluencia ente los ríos Neuquén y Limay, recorre 635 kilómetros hasta su desembocadura en el Océano Atlántico. Lleva un caudal de 1.000 metros cúbicos por segundo. El ancho del valle varía a lo largo de su curso, alternándose tramos de 20 kilómetros con angosturas de menos de 3 kilómetros. En Alto Valle y Valle Medio las bardas que lo rodean son muy altas. En el tramo medio se abre en dos brazos, determinando una serie de islas, la mayor de las cuales es la de Choele Choel Grande. En el tramo inferior su curso da lugar a numerosos meandros, apareciendo brazos secundarios. El río Negro es el tercer río de la Argentina por su longitud, caudal y por su navegabilidad. Presenta dos crecientes anuales, resultantes de los regímenes combinados de los ríos Neuquen y Limay, la de invierno, en el mes de julio, provocada por las lluvias y la de primavera, en septiembre, originada por el deshielo de la nieve.
  
• Río Chubut y Azul: nacen en la provincia. El Azul lleva sus aguas al lago Puelo, integrando el sistema del Manso. La vertiente del Pacífico comprende solo un río, el Manso, que tiene su nacimiento en el Cerro Tronador y presenta en su cuenca trece lagos, entre ellos el Mascardi, Guillelmo, Fonk, Steffen y Martín. En Chile, se une al río Puelo.
  

Los Lagos

Los lagos de Río Negro se ubican en el sector cordillerano, originados por la acción de los glaciares, son profundos, alargados, son alimentados por el deshielo y las abundantes precipitaciones. El lago Nahuel Huapi, compartido por las provincias de Neuquen y Río Negro, se caracteriza por su profundidad y ramificaciones o brazos. Tiene una superficie de 500 Kilómetros cuadrados y posee islas y aguas azules transparentes y muy frías. Otros lagos importantes son Gutiérrez, Mascardi, Marín y Steffen.

Lago Nahuel Huapi 

El lago Nahuel Huapi es un lago de origen glaciar que es compartido por las provincias argentinas del Neuquén (80 %) y de Río Negro (20 %), y rodeado mayormente por el parque nacional homónimo.
El lago posee una superficie de 557 km² y se sitúa a una altitud de unos 700 msnm y se destaca por su profundidad (464 m de profundidad máxima) y sus ocho ramificaciones o brazos: Campanario, de la Tristeza, Blest, Machete, del Rincón, Última Esperanza, Angostura y Huemul. Se relaciona con otros lagos menos extensos, como el Gutiérrez (16,4 km²), el Moreno (16,4 km²), el Espejo y el Correntoso (27 km²). Se alimenta de los deshielos y constituye la naciente del río Limay. Posee varias islas, siendo la más grande e importante por su actividad turística la isla Victoria, de 31 km².
Con su intenso color azul, sus islas, y el paisaje que lo rodea, lo convierten en uno de los lugares más atractivos del sur argentino y un imán para el turismo nacional e internacional, cimentando así un fuerte crecimiento poblacional de sus ciudades ribereñas, lo que ha creado algunos problemas de contaminación de sus aguas.

• Península Llao Llao La península Llao Llao es una península lacustre ubicada al oeste de la provincia de Río Negro, en Argentina. Dentro del Departamento Bariloche, e incluida en el parque nacional Nahuel Huapi y el parque municipal Llao Llao​ Se trata de una extensión de tierra de aproximadamente 1200 hectáreas que separa a los lagos Nahuel Huapi, ubicado al norte y oeste, y Moreno al sur. Presenta un relieve ondulado, con algunas lomadas y pequeños cerros de no más de 300 m de altura, destacándose el cerro Llao Llao.
  

Lago Gutiérrez

El lago Gutiérrez es un lago de origen glaciario ubicado en el Departamento Bariloche el nivel de las aguas del lago ha sido artificialmente aumentado y controlado a mediados del siglo XX, por una esclusa, la cual regulaba el agua a dos usinas, ubicada aguas abajo del arroyo Gutiérrez. Actualmente queda una, que abastece energía a las instalaciones del Ejército argentino. La otra, anteriormente también energizaba al Cerro Catedral, hasta que se le colocó una central térmica, y luego San Carlos de Bariloche quedó conectado en el sistema eléctrico interconectado nacional, con lo cual paso a ser parte de una reserva fría. Por esto, y debido al aumento de su cota, el lago se ha visto modificado, sobre todo en sus playas. Las cuales no solo se han visto muy disminuidas, sino que muchos árboles y arbustos han sufrido la erosión por acción del oleaje.

Lago Mascardi

El lago Mascardi es un lago patagónico que se encuentra dentro del parque nacional Nahuel Huapi, próximo a la ciudad de San Carlos de Bariloche, Patagonia, Argentina. Posee un largo máximo de 23 km; un ancho máximo de 4 km, y una profundidad máxima de 218 m. El lago tiene forma de L o de V, uno de cuyos brazos está alineado en dirección Norte-Sur (Brazo Catedral), mientras que el otro está orientado en dirección Este-Oeste (Brazo Tronador). Su nombre recuerda al misionero jesuita Nicolás Mascardi, que en la segunda mitad del siglo XVII estableciera una misión en las orillas del lago Nahuel Huapi.
Sobre su orilla Este se encuentra la localidad de Villa Mascardi, próxima al lago Guillelmo, punto desde el cual parte un camino de ripio consolidado que conduce hacia el Oeste a lo largo de uno de los brazos del lago y permite acceder a Pampa Linda y al cerro Tronador.
El lago es navegable y se practica la pesca deportiva en sus aguas. Posee numerosas bahías protegidas con juncales que proveen alimento y refugio a una población de salmónidos destacable. En el lago hay dos islas: la "Isla Corazón", emplazada al sur en el brazo Tronador, la cual posee forma de corazón según el punto costero o altura desde la que se la contemple, y un pequeño islote cercano a la costa Oeste. Entre la fauna lacustre que lo habita, se encuentran las especies Fontinalis, arco iris y marrón con un promedio de 1 a 1,5 kg, aunque existen ejemplares de marrones de más de 3 kg.