El Dr Manuel Carlés falleció el 25 de octubre de 1946 a los 78 años de edad.
De 1898 a 1912 fue dirigente nacionalista de varias circunscripciones de la Capital Federal por las que llegó a obtener una banca de diputado. El presidente Hipólito Yrigoyen lo designó en 1918 interventor en la provincia de Salta.
El 5 de abril de 1921 tomó el cargo de Presidente de la Liga Patriótica Argentina, fundada el 19 de febrero de dicho año.
En 1923 el presidente Alvear le otorga la intervención en la provincia de San Juan. Fue profesor del Colegio Militar y de la Escuela Superior de Guerra.
En relación con los conflictos de Santa Cruz, viajó para conformar las filiales de la Liga Patriótica (casi exclusivamente con extranjeros) y organizar las guardias blancas. Volvió rápidamente a Buenos Aires. Posteriormente despidió los restos de Varela y apoyó a uno de los miembros de la Liga como lo fue Pérez Millán (asesino de Wilckens).

Publicó numerosas obras, entre las cuales se destacan Organización de la soberanía; República y democracia y Organización de la economía rural.