Tomás Manuel de Anchorena perteneció a una de las familias más representativas de la clase dirigente de Buenos Aires. Hijo del español don Juan Esteban de Anchorena y de la criolla doña Ramona Josefa López de Anaya. Lo mismo que su hermano mayor, Juan José Cristóbal, se dedicó al comercio y a las especulaciones agropecuarias que lo convirtió en los "ciudadanos más acaudalados y poderosos de esta República, al decir del cónsul Inglés Woodbine Parísh. Tomás Manuel nació el 29 de noviembre de 1783. Realizó sus primeros estudios en la ciudad natal, y se doctoró en la Universidad de Charcas.

De regreso en Buenos Aires, y a pesar de su juventud, Tomás Manuel pasó a desempeñar el cargo de regidor mayor en el Cabildo de la ciudad. Desde el seno de esta institución se opuso al reconocimiento del Consejo de Regencia instalado en Cádiz, actitud que le valió el destierro. La revolución de Mayo de 1810 lo contó entre sus partidarios y acompañó a Belgrano en carácter de secretario cuando el general se hizo cargo del ejército del norte. Realizó toda la campaña del Alto Perú de la que dejó como testimonio sumamente ilustrativo la correspondencia mantenida con su hermano, centrada en asuntos comerciales, pero con abundantes referencias y observaciones acerca de los hombres y los hechos que le tocó conocer y presenciar en aquella fatigosa e Infructuosa expedición. En 1816 fue elegido diputado por Buenos Aires al Congreso de Tucumán.

Su militancia en el grupo antidirectorial no fue lo suficientemente clara como para evitar su enjuiciamiento cuando, a raíz del triunfo de los caudillos federales de 1820, todos los miembros del Congreso fueron sometidos a proceso por traición por haber planeado establecer una monarquía en el país. Apoyó posteriormente la instalación de Martín Rodríguez en el gobierno de Buenos Aires, pero fue opositor de Rivadavia cuando éste asumió la presidencia y puso en marcha la política de centralización que culminó con la sanción de la Constitución unitaria de 1826. Pese a su militancia federal, se distanció de Dorrego a raíz de la decisión de éste de proseguir la guerra contra el Brasil, que Tomás Manuel de Anchorena consideraba ruinosa para la economía de la provincia. Triunfante el golpe unitario del 19 de diciembre de 1828, el gobierno de Lavalle lo confinó con su hermano Juan José Cristóbal en el bergantín Río Bomba, que fue luego capturado con las restantes naves de la escuadra argentina por la flota francesa al mando de Venancourt. Cuando el marino francés desembarcó a los dirigentes federales recluidos en el Río Bamba, Tomás Manuel y su hermano se negaron a aceptar la libertad, y fueron trasladados a un buque de la flotilla inglesa estacionada en el río de la Plata. Esta actitud de respeto de los Anchorena a la soberanía del gobierno provincial fue altamente apreciada y elogiada por Lavalle. Cuando Rosas se hizo cargo del gobierno de la provincia, Tomás Manuel fue designado ministro de Relaciones Exteriores. En 1832 se retiró de la vida política para retomar nuevamente la dirección de sus vastos intereses.

Sustraído por las actividades de su vida privada no aceptó el cargo de gobernador y capitán general de la provincia para el que fuera elegido en 1834. Falleció en Buenos Aires el 29 de Abril de 1847.