En el aspecto militar, se organizó la guardia nacional de la república; fue creado el cuerpo de inválidos; se establecieron cinco grandes divisiones militares y se organizó la inspección general del ejército.
Se llamó a los guerreros de la independencia refugiados en el extranjero y se formó el ejército de línea con enrolamiento general de los ciudadanos en edad militar. Se estableció la nomenclatura de los cuerpos de las tres armas; se organizo la línea de fronteras para contener a los indios.
Fueron creados compañías y regimientos de dragones, de infantería y artillería, en Corrientes, Santa Fe, Mendoza, Santiago del Estero, Salta, San Luis, fronteras del Chaco y Córdoba. Se organizaron prefecturas y subprefecturas fluviales, y la adquisición de buques y armamentos para la armada insumió fuertes sumas, empresa que en aquellas circunstancias no se podía eludir.