Peluffo asumió como Ministro de Relaciones Exteriores en febrero de 1944, simultáneamente con la asunción a la presidencia del General Edelmiro Farrell; se desempeñó hasta diciembre del mismo año. Al momento de asumir, se trataba de un cargo gran importancia en ese momento, debido a la Segunda Guerra Mundial y las presiones de Estados Unidos para que la Argentina entrara en guerra.
La gestión de Peluffo se desarrolló en el marco de una extrema tensión ya que Estados Unidos, Gran Bretaña y la mayor parte de los países americanos no habían reconocido al nuevo gobierno de Farrell y habían retirado sus embajadores. Renunció el 16 de enero de 1945, siendo reemplazado el 8 de febrero por el Dr. César Ameghino. Durante esta última gestión , el 27 de marzo Argentina le declaró la guerra a Alemania y Japón.